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    技術前沿
    circRNA研究匯總 | 20220418-0424
    來源: | 作者:geneseed | 發布時間: 2022-04-25 | 119 次瀏覽 | 分享到:

    歡迎各位來到“circRNA研究報道匯總”欄目,本期從pubmed中檢索收集最新發布的circRNA文獻共計28篇,下面我們一起來看看,circRNA研究最近有哪些新進展。

    檢索式:(circRNA[Title/Abstract]) OR Circular RNA[Title/Abstract]

     

     

    1.在胰腺導管腺癌中,Circular RNA circ-MTHFD1L通過miR-615-3p/RPN6軸誘導HR修復以促進吉西他濱耐藥

    標題:Circular RNA circ-MTHFD1L induces HR repair to promote gemcitabine resistance via the miR-615-3p/RPN6 axis in pancreatic ductal adenocarcinoma

    雜志:J Exp Clin Cancer Res

    影響因子:11.161

    通訊作者:陳實副主任醫師,田毅峰主任醫師和黃龍主治醫師(福建省立醫院肝膽胰外科)

    背景:胰腺癌耐藥是導致胰腺癌患者治療效果不佳的主要原因。探索化療耐藥相關基因一直是腫瘤學研究的難點和熱點。大量研究表明,環狀RNAs(circRNAs)在胰腺癌的發生發展中起著關鍵作用。然而,環狀RNAs在胰腺導管腺癌(PDAC)化療耐藥過程中的調控作用尚不完全清楚。

    方法:基于GEO數據庫與本中心數據的交叉分析,作者發現了一個與化療耐藥相關的新分子hsa_circ_0078297 (circ-MTHFD1L)。利用QRT-PCR檢測環狀RNAs、miRNAs和mRNAs在人類PDAC組織及其匹配的正常組織中的表達。circ-MTHFD1L與miR-615-3p/RPN6信號軸的相互作用通過雙熒光素酶報告基因檢測、熒光原位雜交(FISH) RNA免疫沉淀(RIP)檢測等一系列實驗得到證實。

    結果:Circ-MTHFD1L在PDAC組織和細胞中顯著升高。在PDAC患者中,circ-MTHFD1L表達水平越高,預后越差。機制分析顯示circ-MTHFD1L作為內源性miR-615-3p海綿上調RPN6的表達,從而促進DNA損傷修復,發揮其增強吉西他濱化療耐藥性的作用。更重要的是,作者還發現沉默circle-MTHFD1L聯合奧拉帕尼可以增加胰腺癌對吉西他濱的敏感性。

    結論:Circ-MTHFD1L通過miR-615-3p/RPN6信號軸維持PDAC吉西他濱耐藥。Circ-MTHFD1L可能是有效治療PDAC的分子標志物。

                

    PDAC細胞中的circ-MTHFD1L/miR-615-3p/RPN6信號機制圖

     

    2.巨噬細胞中的CircACTR2通過激活巨噬細胞炎癥和腎小管上皮細胞的上皮-間質轉化促進腎纖維化

    標題:CircACTR2 in macrophages promotes renal fibrosis by activating macrophage inflammation and epithelial-mesenchymal transition of renal tubular epithelial cells

    雜志:Cell Mol Life Sci

    影響因子:9.261

    通訊作者:王國慧副研究員(中南大學湘雅三醫院胃腸外科)

    巨噬細胞和小管上皮細胞(TECs)之間的相互作用積極調控腎纖維化的進展。在本研究中,作者揭示了環狀RNA ACTR2 (circACTR2)在調節巨噬細胞炎癥、上皮-間質轉化(epithelial-mesenchymal transition, EMT)和腎纖維化發展中的意義。結果顯示,UUO(單側輸尿管梗阻)誘導的腎纖維化與炎癥和EMT的增加、對側腎臟肥大、circACTR2和NLRP3的上調以及miR-561的下調相關。CircACTR2充分而本質地促進了巨噬細胞NLRP3炎癥小體的激活、焦亡和炎癥,并通過旁分泌作用刺激了TECs的EMT和纖維化。在機制上,circACTR2海綿化miR-561并上調NLRP3表達水平,誘導IL-1β的分泌。在TECs中,IL-1β通過上調fasin -1誘導腎纖維化。在體內,敲低circACTR2或升高miR-561可有效緩解腎纖維化。綜上所述,circACTR2通過海綿化miR-561激活NLRP3炎癥小體,促進巨噬細胞炎癥反應,刺激巨噬細胞誘導的EMT和TECs纖維化。因此,敲低circACTR2和過表達miR-561可能有利于腎纖維化的治療。

     

    circACTR2通過海綿機制參與炎癥反應,并誘導腎臟纖維化

     

    3. circFAM120B在食管鱗癌中通過miR-661/PPM1L軸和PKR/p38 MAPK/EMT通路發揮腫瘤抑制作用

    標題:circFAM120B functions as a tumor suppressor in esophageal squamous cell carcinoma via the miR-661/PPM1L axis and the PKR/p38 MAPK/EMT pathway

    雜志:Cell Death Dis

    影響因子:8.469

    通訊作者:王建明教授(南京醫科大學公共衛生學院)

    circRNA表達的廣泛變化強調了它們對癌癥的多種特征的重要貢獻;但其在食管鱗癌中的作用及機制尚不明確。在這里,作者采用了一種三步走的方法,首先篩選ESCC中顯著差異表達的環狀RNAs,然后進行外部驗證研究,然后進行功能分析。通過Sanger測序、RNase R酶切、放線菌素D處理、亞細胞定位分析和熒光原位雜交來評估環狀RNAs的特性。使用在線工具預測目標轉錄本,并通過雙熒光素酶、RNA免疫沉淀、qRT-PCR和western blot進行驗證。生物素標記的RNA-protein pull-down、質譜和RNA免疫沉淀被用來鑒定與環狀RNAs相互作用的蛋白。作者進行了功能獲得和功能喪失實驗,以揭示環狀RNAs及其靶基因和結合蛋白在增殖、轉移和侵襲中的作用。作者觀察到circFAM120B (hsa_circ_0001666)在癌組織和患者血漿中經常下調,其表達水平與ESCC患者的總生存期有關。過表達circFAM120B可抑制ESCC的增殖、轉移和侵襲,而沉默circFAM120B可增強惡性表型。在機制上,circFAM120B主要位于細胞質中,保證其對miR-661的海綿作用,以恢復腫瘤抑制因子PPM1L的表達。作者觀察到,circFAM120B可以通過促進RNA依賴性蛋白激酶(PKR)的泛素依賴性降解,進而調控p38 MAPK信號通路,降低其穩定性,從而抑制ESCC細胞中的EMTs。研究結果表明,circFAM120B是一種很有前途的ESCC生物標志物,它通過circFAM120B/miR-661/PPM1L軸和PKR/p38 MAPK/EMT通路發揮腫瘤抑制作用,支持其作為候選治療靶點的重要性。   

     

    circFAM120B參與ESCC,發揮腫瘤抑制作用的機制

     

     

     

     

     

    文獻列表

    序號

    主要內容

    論文標題

    雜志

    IF

    單位

    1

    在胰腺導管腺癌中,Circular RNA circ-MTHFD1L通過miR-615-3p/RPN6軸誘導HR修復以促進吉西他濱耐藥

    Circular RNA circ-MTHFD1L induces HR repair to promote gemcitabine resistance via the miR-615-3p/RPN6 axis in pancreatic ductal adenocarcinoma

    J Exp Clin Cancer Res

    11.161

    福建醫科大學

    2

    巨噬細胞中的CircACTR2通過激活巨噬細胞炎癥和腎小管上皮細胞的上皮-間質轉化促進腎纖維化

    CircACTR2 in macrophages promotes renal fibrosis by activating macrophage inflammation and epithelial-mesenchymal transition of renal tubular epithelial cells

    Cell Mol Life Sci

    9.261

    中南大學湘雅三醫院胃腸外科

    3

    circFAM120B在食管鱗癌中通過miR-661/PPM1L軸和PKR/p38 MAPK/EMT通路發揮腫瘤抑制作用

    circFAM120B functions as a tumor suppressor in esophageal squamous cell carcinoma via the miR-661/PPM1L axis and the PKR/p38 MAPK/EMT pathway

    Cell Death Dis

    8.469

    南京醫科大學

    4

    非編碼RNAs在肝細胞癌代謝重編程調控中的作用及機制

    The role and mechanism of noncoding RNAs in regulation of metabolic reprogramming in hepatocellular carcinoma

    Int J Cancer

    7.396

    四川大學華西醫院肝臟外科與肝移植科

    5

    PltDB:用于疾病調查的基于血小板的基因表達數據庫

    PltDB: a blood platelets-based gene expression database for disease investigation

    Bioinformatics

    6.937

    華中科技大學同濟醫學院協和醫院

    6

    調節上皮-間充質轉化的非編碼RNAs:肝病的研究進展

    Non-coding RNAs regulating epithelial-mesenchymal transition: Research progress in liver disease

    Biomed Pharmacother

    6.529

    南京中醫藥大學附屬張家港中醫院

    7

    miR-195-5p在人類實體癌中的作用和機制

    Roles and mechanisms of miR-195-5p in human solid cancers

    Biomed Pharmacother

    6.529

    南京醫科大學第一附屬醫院普外科

    8

    非編碼RNAs及其在紫杉醇化療中的治療:起始、進展和藥物敏感性的機制

    Noncoding RNAs and their therapeutics in paclitaxel chemotherapy: Mechanisms of initiation, progression, and drug sensitivity

    J Cell Physiol

    6.384

    伊斯蘭阿扎德大學,伊朗內沙布爾醫科大學

    9

    急性淋巴細胞白血病中的線性和環狀長非編碼RNAs:從發病到分類和治療

    Linear and Circular Long Non-Coding RNAs in Acute Lymphoblastic Leukemia: From Pathogenesis to Classification and Treatment

    Int J Mol Sci

    5.923

    浙江大學醫學院

    10

    在骨關節炎中,環狀RNA circ_0000423通過circ_0000423/miRNA-27b-3p/MMP-13軸調控軟骨ECM合成

    Circular RNA circ_0000423 regulates cartilage ECM synthesis via circ_0000423/miRNA-27b-3p/MMP-13 axis in osteoarthritis

    Aging (Albany NY)

    5.682

    廣州中醫藥大學,中山大學

    11

    circHECTD1可減弱急性肺損傷肺泡上皮細胞的凋亡

    circHECTD1 attenuates apoptosis of alveolar epithelial cells in acute lung injury

    Lab Invest

    5.662

    鄭州大學第一附屬醫院重癥醫學科

    12

    在妊娠期糖尿病期間,circMAP3K4通過調節miR-6795-5p/PTPN1軸調控滋養細胞的胰島素抵抗

    circMAP3K4 regulates insulin resistance in trophoblast cells during gestational diabetes mellitus by modulating the miR-6795-5p/PTPN1 axis

    J Transl Med

    5.531

    中國醫科大學附屬盛京醫院內分泌科

    13

    環狀RNA circNIPBL通過基底部切除修復途徑促進支氣管上皮細胞nnk誘導的DNA損傷

    Circular RNA circNIPBL promotes NNK-induced DNA damage in bronchial epithelial cells via the base excision repair pathway

    Arch Toxicol

    5.153

    廣州醫科大學

    14

    法舒地爾治療APPswe/PSEN1dE9轉基因(APP/PS1)小鼠阿爾茨海默病的轉錄組分析

    Transcriptome analysis of fasudil treatment in the APPswe/PSEN1dE9 transgenic (APP/PS1) mice model of Alzheimer's disease

    Sci Rep

    4.379

    山西大同大學醫學院,山西中醫藥大學

    15

    乳腺癌來源的外泌體通過circHIPK3/miR-124-3p/MTDH軸促進微環境中內皮細胞的血管生成

    Breast cancer derived exosomes promoted angiogenesis of endothelial cells in microenvironment via circHIPK3/miR-124-3p/MTDH axis

    Cell Signal

    4.315

    華中科技大學同濟醫學院武漢中心醫院甲狀腺乳腺外科

    16

    蘋果環狀RNA在根、韌皮部、葉、花和果實中的表達特征

    Expression Characteristics in Roots, Phloem, Leaves, Flowers and Fruits of Apple circRNA

    Genes (Basel)

    4.096

    中國農業科學院農業農村部果樹研究所

    17

    遠端缺血后適應過程中CircRNA和miRNA的表達譜可減輕腦缺血/再灌注損傷

    CircRNA and miRNA expression profiles during remote ischemic postconditioning attenuate brain ischemia/reperfusion injury

    Brain Res Bull

    4.077

    云南省第一人民醫院普外科二科,昆明醫科大學

    18

    Circ_100395在甲狀腺乳頭狀癌中阻礙惡性腫瘤和糖酵解:涉及PI3K/AKT/mTOR信號通路

    Circ_100395 impedes malignancy and glycolysis in papillary thyroid cancer: involvement of PI3K/AKT/mTOR signaling pathway

    Immunol Lett

    3.685

    武漢大學附屬中南醫院甲狀腺乳腺外科

    19

    環狀RNA:精神分裂癥病理生理學中一種新的潛在調節因子

    Circular RNA: A novel and potential regulator in pathophysiology of schizophrenia

    Metab Brain Dis

    3.584

    魯爾克拉國立理工學院生命科學系

    20

    下調circATXN7通過釋放miR-7-5p抑制非小細胞肺癌的生長

    Downregulation of circATXN7 represses non-small cell lung cancer growth by releasing miR-7-5p

    Thorac Cancer

    3.500

    山西省腫瘤醫院,中國醫學科學院腫瘤醫院附屬山西醫院,山西醫科大學附屬腫瘤醫院

    21

    circ_0004788/miR-515-5p/FGF2網絡在鼻咽癌發展中的調控作用的確定

    Identification of the regulatory role of the circ_0004788/miR-515-5p/FGF2 network in nasopharyngeal carcinoma development

    Head Neck

    3.147

    徐州醫科大學附屬淮安醫院放射腫瘤科

    22

    RNA circTLK1通過靶向miR-26a-5p/DAPK1調控帕金森病中多巴胺能神經元損傷

    Circular RNA circTLK1 regulates dopaminergic neuron injury during Parkinson's disease by targeting miR-26a-5p/DAPK1

    Neurosci Lett

    3.046

    同濟大學醫學院附屬東方醫院放射科

    23

    CircCDC6通過調控miR-3187-3p及其下游PRKAA2抑制結直腸癌腫瘤生長和糖酵解能量代謝

    CircCDC6 restrains tumor growth and glycolysis energy metabolism in colorectal cancer via regulating miR-3187-3p and downstream PRKAA2

    J Bioenerg Biomembr

    2.945

    武漢市第一醫院胃腸外科

    24

    Circ_0075804通過靶向miR-1287-5p調控LASP1的表達,從而影響視網膜母細胞瘤的生物學過程

    Circ_0075804 Regulates the Expression of LASP1 by Targeting miR-1287-5p and Thus Affects the Biological Process of Retinoblastoma

    Curr Eye Res

    2.424

    山東省棗莊市醫院眼科

    25

    外泌體環狀RNA hsa_circ_0006220、hsa_circ_0001666作為診斷胰腺癌的生物標志物

    Exosomal circular RNA hsa_circ_0006220, and hsa_circ_0001666 as biomarkers in the diagnosis of pancreatic cancer

    J Clin Lab Anal

    2.352

    寧波大學醫學院附屬醫院放射科

    26

    hsa_circ_0000285通過調控miR-127-5p/CDH2促進甲狀腺癌進展

    hsa_circ_0000285 facilitates thyroid cancer progression by regulating miR-127-5p/CDH2

    J Clin Lab Anal

    2.352

    四川省人民醫院,中國科學院四川轉化醫學研究醫院

    27

    Circ_0030998通過介導miR-1323/PDCD4軸抑制非小細胞肺癌順鉑耐藥

    Circ_0030998 Restrains Cisplatin Resistance Through Mediating miR-1323/PDCD4 Axis in Non-small Cell Lung Cancer

    Biochem Genet

    1.890

    中國科學院電子科技大學四川省人民醫院

    28

    Circ_0088036通過miR-1263/ rel -活化的NF-κB通路介導類風濕關節炎成纖維細胞樣滑膜細胞的進展和炎癥

    Circ_0088036 mediated progression and inflammation in fibroblast-like synoviocytes of rheumatoid arthritis by miR-1263/REL-activated NF-κB pathway

    Transpl Immunol

    1.708

    蘭州大學第二醫院風濕免疫科

     


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