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    標題摘要內容
    高通量測序
    RNA免疫共沉淀測序(RIP seq)
    來源: | 作者:geneseed | 發布時間: 2017-09-02 | 25914 次瀏覽 | 分享到:


            RNA
    免疫共沉淀(RNA Immunoprecipitation,RIP )是研究細胞內RNA與蛋白結合情況的技術,是了解轉錄后調控網絡動態過程的有力工具,能幫助我們發現miRNA的調節靶點。 RIP這種技術運用針對目標蛋白的抗體把相應的RNA-蛋白復合物沉淀下來,然后經過分離純化獲得結合在復合物上的RNA,再通過高通量測序實現對目的RNA的信息分析。RIP技術與高通量測序的結合,能幫助研究人員更好的了解癌癥以及其它疾病整體水平的RNA變化。

    技術路線

     

    圖釋:RIP-sequencing實驗流程(Zhao et al.  Mol Cell,2010

    樣本要求

            樣品類型:RIP實驗分離的RNA樣品

            物種:人、大小鼠(特殊物種詳詢技術支持)

            具體樣品量要求及樣本采集、保存和運輸方法請參照附錄一。

    測序方案

            測序模式PE150

            測序數據量10Gb

    生物信息分析內容

            1 原始數據質控檢查

            2 比對結果質控檢查

            3 測序reads全轉錄組分布圖

            4 富集基因的鑒定及定量

            5 富集基因表達及相關通路分析

            6 富集環狀RNA的預測及鑒定

            7 富集環狀RNA宿主基因的通路分析
            
    8 富集長鏈非編碼RNA表達分析



    吉賽生物NGS樣本采集、保存、運輸要求(2020年version2.2)

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